行政院12日核定，自98年4月13日起廢止營利事業統一發證制度，未來公司組織依公司法辦理公司登記，獨資、合夥之商業依商業登記法辦理商業登記後，將不需再辦理「營利事業登記」及取得「營利事業登記證」，將可大為簡化企業申設流程，提升經商容易度，並強化國家競爭力。

經濟部商業司表示，監察院是在民國87年即建議採行「登記與管理分離」原則及廢止營利事業統一發證制度，後經行政院經建會委員會同意將行政管理與商業登記分離，並廢止營利事業統一發證制度，並於88年9月10日經行政院核定。

不過，配合廢止營利事業統一發證制度所需修正的相關法律，一直到今年1月21日才完成修法程序，並經行政院於3月12日核定，營利事業統一發證制度之施行期限至98年4月12日止，也就是說，自98年4月13日起，公司組織依公司法辦理公司登記，獨資、合夥之商業依商業登記法辦理商業登記後，不需再行辦理「營利事業登記」及取得「營利事業登記證」。