法院就當事人爭執之事實，如仍無法依自由心證判斷真偽不明時，法院不得拒絕判決，必須依舉證責任分配之規定，將該真偽不明之不利益歸由一造當事人承擔，該造當事人即負有舉證責任。有關舉證責任，目前通說採取「特別要件說」，主張權利存在之當事人，就權利發生事實負有舉證責任；主張權利不存在之人，就權利障礙事實、權利消滅事實或權利排除事實負有舉證責任。一般而言，原告負擔請求權基礎之要件事實舉證責任；而若是「消極確認訴訟」，則應由被告負擔。
